Tummelisa är en pytteliten flicka som lever i harmoni med naturen bland blommorna i Twillerbees magiska värld. När den bortskämda flickan Makena plockar de blommor som Tummelisa och hennes två vänner bor på, hamnar de i en lyxig våning mitt i stan. Där får de höra talas om de byggnadsplaner som hotar att ödelägga hela Twillerbees värld! Med hjälp av naturens magiska krafter måste Tummelisa nu bevisa att även den minsta personen kan göra stor skillnad.