Botchan heeft een sterk rechtvaardigheid gevoel en liegt niet. Hij krijgt een baan aangeboden in een midden in een klein dorp ver weg van zijn geboortestad Tokio. Botchan accepteert de positie en begint te werken als wiskundeleraar. Het assistent -principe daar heeft absolute macht. Botchan heeft het moeilijk om met zijn collega -leraren en de studenten om te gaan.