La squadra dell'NCIS, dopo aver rinvenuto il corpo senza vita di un capitano della Marina, sotto la cui uniforme è nascosto un insolito costume, si trova ad indagare nel mondo di supereroi mascherati che, in un gruppo simile a vigilantes, ogni giorno combattono i criminali. Collabora nell'indagine della squadra dell'NCIS la giornalista Wendy, ex compagna dell'agente Anthony Dinozzo.