Dans un avion sur le point de se poser à Los Angeles, une jeune femme est retrouvée morte dans les toilettes de l'appareil. Elle rejette du sang par les yeux et par les narines. Elle accompagnait un trafiquant en possession de fioles de variole. Callen et Sam, accompagnés par Danny Williams et Chin Ho Kelly de la police fédérale d'Hawaii, arrivent trop tard à l'aéroport de Los Angeles pour intercepter le trafiquant.